Başbakanlık, yaşanan istifalar sonrasında İstanbul 2010 Kültür Başkenti Ajansı için devrede. Ajansta Yürütme Kurulu Başkanı bulunmaması nedeniyle, karar mekanizması çöktü. Çoğunluğu sağlayamayan kurulda karar alınamaması ve onaylanmış projelere ödenek aktarılamaması nedeniyle ajansın çalışmaları da durdu. Başbakan Recep Tayyip Erdoğan, ajanstaki iddiaların tartışmalara neden olması nedeniyle, olaya el koydu. Ajansa ilişkin iddiaların araştırılmasını ve sorunun tespit edilerek çözülmesini isteyen Başbakan Erdoğan, Başbakanlık Teftiş Kurulu'na inceleme talimatı verdi. Kuruldan bir müfettiş ile Maliye Bakanlığı ve İçişleri Bakanlığı'ndan birer müfettiş görevlendirilerek İstanbul'a gönderildi. Bir ay boyunca İstanbul'da kalacak müfettişler, ajansı mercek altına alacak. Müfettişler, hazırladıkları raporu Başbakan Erdoğan'a sunacak. Ajansın başkan vekili, Kültür ve Turizm Bakanlığı İstanbul İl Kültür Müdürü Dr. Ahmet Emre Bilgili, şu an sadece maaş gibi acil konular için imza yetkisini kullanıyor. Bilgili, İstanbul için hazırlanan tüm projelerin durma noktasına geldiğini vurguluyor ve 2010'a yalnızca dokuz ay kaldığının altını çiziyor.