Gümrük Yönetmeliği'nde değişiklik konusu yargıya da aksettirilmiş durumda. Danıştay'a gönderilmek üzere İstanbul Nöbetçi İdare Mahkemesi'ne yapılan başvuruda, "yürütmenin durdurulması ve kararın iptali istendi. Dava dilekçesinde, Gümrük Yönetmeliği'nin 699. maddesinin Anayasa'nın 48'inci maddesine aykırı olduğu belirtilerek, "Anayasa'nın 48'inci maddesine göre herkes dilediği alanda çalışma ve sözleşme hürriyetine sahiptir, özel teşebbüsler kurmak serbestir" ifadesine dikkat çekildi. Yine dilekçede söz konusu maddenin Gümrük Kanunu'na da aykırı olduğu dile getirilerek iptali istendi.