Bolu Tüneli'nde kullanılan havalandırma dünyanın sayılı tünellerinde kullanılan bir sistemden oluşturuldu. Tünellerde en büyük tehlikeyi oluşturan yangın için de uluslarası standartlarda düzenekler hazırlandı. İki tüp arasında 500 metre arayla acil durumlarda kullanılmak üzere araç geçişleri ve yayaların çıkabilmesi için kısa aralıklarla çıkış kapıları oluşturuldu. Tünelde kullanılan kablo, boruve çıkış kapıları 400 derece sıcaklığa 90 dakika dayanabiliyor.