Marmaray77 kilometre üzerinde 40 istasyonu ile hizmet verecek. Gebze'den yolcu alan Marmaray tren yolu üzerinden Söğütlüçeşme'ye gelecek. Burada yer altına inip Harem üzerinden Üsküdar'a varacak ve tüp geçişe girecek. Boğazı geçip Sirkeci'den yer altına girecek ve Yedikule'de yüzeye çıkıp, var olan sisteme entegre olacak.
