Francis Fukuyama, kurucuları arasında ABD Savunma Bakanı Donald Rumsfeld, bugün Dünya Bankası Başkanı olan Paul Wolfowitz ve Richard Perle gibi şahin politikacıların olduğu düşünce kuruluşu Project for the New American Century'nin ABD Başkanı Bill Clinton'a yazdığı mektupta imzası olanlar arasındaydı. 1998 yılındaki mektup Irak lideri Saddam Hüseyin'in devrilmesinin ABD çıkarları için gerekliliğine işaret ediyordu. Fukuyama George W. Bush önderliğindeki ABD Irak'a saldırdığında da neoconlar olarak anılan bu grubun yanındaydı. Ancak daha sonra bu
görüşlerinden vazgeçen ünlü düşünür. Saldırı yerine insanların kalplerinin fethedilerek müslüman dünya ile ilişki kurulması gereğine dikkat çekti. Fukuyama George Bush'u seçimlerde desteklemeyerek rakibi Kerry'e oy atacağını açıkladı. Fukuyama adını "Tarihin Sonu" teziyle duyurmuştu. Düşünür bu tezinde, bütün medeniyetlerin batı medeniyeti potasında eriyeceği vurgulamakta ve batı dışında kalan milletlerin sahip oldukları medeniyetleri yitirerek, medeniyetsiz kalacağı ileri sürdü. Francis Fukuyama'ya göre liberal demokrasi ebedi bir zafer kazanmıştı ve hiçbir sistem liberal demokrasiye direnemeyecekti.
