TÜRKONFED'dekiyapılanmaya göre Türkiye, Batı Anadolu, Marmara ve Kuzey Anadolu, İç Anadolu, Doğu ve Güneydoğu Anadolu, Doğu Akdeniz olmak üzere 5 federasyona ayrıldı. Buna ek olarak bir de Sektörel Dernekler Federasyonu oluşturuldu. Konfederasyon Yönetim Kurulu'nda bu 6 federasyondan ikişer üye bulunuyor. Konfederasyon başkanlığı üç, yönetim kurulu üyelikleri ise dört dönemle sınırlı tutuldu. Ayrıca 8 yıldır sürdürülen SİAD Zirvesi Türk Girişim ve İş Dünyası Zirvesi olarak devam edecek.