2000 yılına gelindiğinde yukarıdaki programlar sürerken MBA yepyeni bir biçim alıyor. Ve Tam Zamanlı MBA'in yerine konan yeni MBA programıyla çalışan öğrencilerin yöneticilik yolundaki gereksinimleri doğrultusunda, işletme yönetimi alanında 21. yüzyılda öne çıkacak uzmanlık alanlarında yetişmeleri sağlanıyor. Yeni programlar, yeni yöneticiler: "MBA 2000" atılımıyla birlikte BİLGİ'de yüksek lisans programlarının yeni yöneticileri de göreve başladı. İstanbul Bilgi Üniversitesi İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi öğretim üyesi Prof. Dr. Beyza Furman, tüm Yüksek Lisans Programları'nın koordinasyonunu yapan Sosyal Bilimler Enstitüsü'nün müdürlüğüne atandı.

MBA programları direktörlüğüne ise MBA eğitimi konusunda Avrupa'nın önde gelen okurlarından biri olan Manchester Business School öğretim üyesi İsmail Ertürk getirildi.