Emil Zatopek parlak Olimpiyat kariyerine 1948 Londra Olimpiyatları'nda 10.000 m koşarak başladı. 25 turluk yarışın onuncu etabında liderliği eline geçirdi. Sonuçta iki atlete tur bindirdi ve yarışı 300 m'den fazla bir farkla birinci bitirdi. Sadece üç gün sonra 5.000 m finalinde koştu. Final turunun başında, 50 metrelik bir farkla Belçikalı Gaston Reiff'i izliyordu. müthiş bir atakla rakibini giderek daha yakınlaşarak sıkıştırmaya başladığında seyirciler ayağa kalkmıştı. Ancak Reiff, tam zamanında farkına varmış ve yarışı 1,5 m farkla kazanmayı başarmıştı. 1948'deki başarıları etkileyiciydi, fakat 1952 Helsinki'de elde ettiği başarılar düşünüldüğünde bu sadece bir başlangıçtı. oyunlara 10.000 m'yi 100m farkla kazanarak başladı. 5.000 m'de yarım tur farkla dördüncüydü, fakat final turunda atağa kalkarak liderliği ele aldı ve yarışı beş metre farkla kazandı. Aynı günün öğleden sonrasında eşi Dana, cirit atmada altın madalya kazandı. Zatopek ise daha önce hiç koşmamış olmasına rağmen maraton yarışına girdi. Buna rağmen bütün atletleri geride bırakıp, yarışı 2,5 dakikalık bir farkla kazanırken Fin seyirciler onu ayakta alkışlıyordu. Emil Z5.000 m, 10.000 m ve maratonu aynı yarışlarda kazanan tek atlet oldu. Ünlü atlet Olimpiyatlardan altı hafta önce fıtık teşhisi konulmasına karşın 1956 Melbourne Olimpiyat oyunlarında maraton koştu, ancak bu kez altıncılıkla yetinmek zorunda kaldı.