Yaprak'ın bu saltanatı Hatay Cumhuriyet Başsavcılığı'na 30 Ekim 2000 tarihinde gönderilen ihbar yazısıyla ortaya çıktı. Gaziantep Cumhuriyet Başsavcılığı, Çınar hakkında "görevini kötüye kullanmak" suçundan dava açtı. Çınar'ın hükümlü olarak cezaevinde kalan bir kişiyle cezaevi bahçesinde çay içip mesleğin şeref ve nüfusunu yitirecek derecede ilişki kurduğunun belirtildiği iddianamede Çınar'ın Yaprak'a sağladığı iltimaslar şöyle sıralandı:
*Mehmet Ali Yaprak'ın koğuşunu modern şekilde tefriş etmesine,
*Cezaevi dış bahçesine süs havuzu, çiçeklik ve iki doberman cinsi köpek için kulübe inşa ettirip burada beslemesine,
*Ziyaretçiler için verilen 15-20 dakikalık görüş iznini 4-5 saate varacak derecede uzatıp, açık görüş haline dönüştürmesine,
*Mehmet Ergenç ve Mustafa Gürbüz isimli hükümlülerle dış bahçeye çıkıp burada ziyaretçi kabul etmesine göz yumduğu,
*M.Ali Yaprak'ın cezaevinde verdiği yemeğe diğer Cumhuriyet Savcısı, Kaymakam ve Emniyet Amiriyle birlikte katıldığı anlaşılmıştır.
Yaprak'ın cezaevinde verdiği yemeğe katılan ilçe kaymakamı ve emniyet amiri hakkında da İçişleri Bakanlığı'nın idari tahkikat başlattığı öğrenildi.