Türk Silahlı Kuvvetleri de, Avrupa Birliği standartları doğrultusunda, yeni bir protokole tabi tutulacak. Genelkurmay Başkanı, Avrupa ülkelerinde olduğu gibi, Milli Savunma Bakanlığı'na bağlanacak.

AB sürecinde, Genelkurmay Başkanı'nın protokoldeki yerini belirleyen Anayasa'nın 117'nci maddesinin değişmesi bekleniyor. Bu madde "Genelkurmay Başkanı, görev ve yetkilerinden dolayı Başbakan'a karşı sorumludur. Milli Savunma Bakanlığı'nın, Genelkurmay Başkanlığı ve Kuvvet Komutanlıkları ile görev ilişkileri ve yetki alanı kanunla düzenlenir" hükmünü içeriyor. Bu maddenin "Genelkurmay Başkanı, görev ve yetkilerinden dolayı Milli Savunma Bakanı'na karşı sorumludur" şeklinde değiştirilmesi bekleniyor.

Böylece ulusal ve uluslararası toplantılarda Genelkurmay Başkanı, Milli Savunma Bakanı'nın arkasında oturacak. Şu anda uygulanan protokol gereği Genelkurmay Başkanı, Milli Savunma Bakanı'nın önünde bulunuyor. Genelkurmay Başkanı daha önde olduğu için birçok uluslararası toplantıya da iki isim birden katılmıyor. Halen uygulanan protokolde TBMM Başkanı, Başbakan ve Anayasa Mahkemesi Başkanı'ndan sonra dördüncü sırada Genelkurmay Başkanı yer alıyor ve 0004 plakalı araca biniyor.