Sezer'in ilk kez başkanlık ettiği 30 Mayıs 2000 tarihli toplantıda, ülke genelindeki güvenlik ve asayiş durumu ile yasadışı irticai, bölücü- yıkıcı terör örgütleri ve organize suç örgütlerinin faaliyetleri ele alınmıştı. Tarihe geçen MGK toplantısı ise Sezer'in Ecevit'in başbakan olduğu Anayasa kitapçığının fırlatıldığı toplantıydı. Bu olayın ardından ağır ekonomik kriz patlak vermişti. İlginç toplantılardan biri de 18 Nisan 2005'te Başbakan Yardımcısı Mehmet Ali Şahin'in Olimpiyat Stadı'nda oynanacak Şampiyonlar Ligi final maçına kimlerin gelmek istediğini sormasıydı.