2006 yılını 2.1 milyar YTL kârla kapatarak Türkiye'nin en kârlı kuruluşu ünvanını kazanan Ziraat Bankası'nın, 2005 yılındaki kârı sıkıntılı bir sürece yolaçtı. Ziraat, 2005 için 1.8 milyar YTL kâr açıkladı ancak BDDK 260 milyon YTL'lik bölümünü kabul etmedi. Bakan Babacan'ın yazdığı mektup, kâr düzeltmesini sağladı. Emlakbank'ın, Ziraat Bankası'na devredilmesi sonrasında, tasfiye edilen bu bankadan kaynaklanan görev zararlarının Hazine tarafından Ziraat'e ödenmesi kararlaştırıldı. Ancak bu ödeme için Hazineden Sorumlu Bakan Ali Babacan'dan onay alınması gecikti. Ziraat Bankası'nın hesaplarını inceleyen bankalar yeminli murakıpları, 2005 kârının 260 milyon YTL'lik bölümünü kabul etmedi. Babacan, 2005 yılı içinde Emlakbank'tan kaynaklanan görev zararlarının Ziraat'e ödenmesine olanak veren imzayı, Ocak 2006'ya bıraktı. Bu durum Ziraat Bankası ile Bankacılık Düzenleme ve Denetleme Kurumu'nu karşı karşıya getirdi. 2005'e ilişkin konsolide kârın hesabı, rötarlı imza yüzünden değişti. Kâr krizinin aşılması için daha sonra Hazine bürokrasisi BDDK'nın da kabul ettiği bir formül geliştirdi. Bakan Babacan, "Attığım imza 2005 yılına ilişkindir" yönünde bir yazı gönderince, Ziraat'in 2005 yılı kârı BDDK tarafından da kabul edildi. Böylece 1 milyar 542 milyon YTL'ye çekilmesi istenen 2005 yılı kârı, düzeltilerek 1 milyar 802 milyon YTL olarak açıklandı ve denetimden geçerek uygun bulundu.
